Due to the heterogeneity of many real biochemical systems,
stochastic simulation methods do not scale well as systems
become more complex and larger, whereas approximations
provided by continuous models fail to capture the stochas-
tic behavior of molecular species at very low numbers. A
hybrid simulation method is a natural idea to resolve this
dilemma. In this paper, we propose a novel notion of Petri
net called hybrid adaptive Petri net (HAPN), which is a
unified framework to conveniently in